A atualização, que trará a versão 3.0.12 de Super Mario Run, o tornará incompatível com versões do sistema operacional mais baixas que 4.4. Quem ainda o tiver, não poderá baixar ou atualizar o jogo, e versões anteriores também não poderão mais ser executadas.
Super Mario Run chegou à Play Store no dia 22 de março de 2017. Hoje, dois anos depois, o segundo aplicativo para dispositivos móveis da Nintendo — seguido do já descontinuado Miitomo — segue constantemente atualizado.